根據黨中央、國務院關于加強注冊會計師和企業(yè)高級財務管理人員培養(yǎng)的精神，上海國家會計學院于2000年9月正式組建。學院是財政部直屬事業(yè)單位，由財政部和上海市人民政府雙重領導，實行董事會領導下的院長負責制。國家會計學院董事會由財政部，中央組織部，發(fā)展改革委，教育部，人力資源社會保障部，商務部，人民銀行，審計署，國資委，稅務總局，銀監(jiān)會，證監(jiān)會，臺辦，北京市人民政府，上海市人民政府，福建省人民政府，廈門市人民政府，北京市財政局，上海市財政局，廈門市財政局，清華大學，上海財經大學，廈門大學，財政部會計司，財政部人事教育司，財政部干部教育中心，北京國家會計學院，上海國家會計學院，廈門國家會計學院等單位的有關領導組成，現任財政部部長任董事會主席。學院還是中國政府倡導設立的亞太財經與發(fā)展中心（AFDC）所在地，該中心是中國政府在AFDC框架下倡導建立的第一個旨在促進區(qū)域能力建設的機構。

　　學院校區(qū)位于上海市青浦區(qū)徐涇鎮(zhèn)蟠龍路200號，占地面積520畝，建筑面積約為8.7萬平方米，工程建設總投資8.08億元人民幣。校園三面環(huán)水，景色怡人，綠化覆蓋率高達64.6％。學院在上海財經大學中山北一路校區(qū)還設有培訓分部。

　　1995年6月22日，時任國務院副總理朱镕基在有關國家會計學院基地建設的批示中指出：“舉辦注冊會計師培訓中心很有必要，這是根據江澤民同志關于要培養(yǎng)30萬注冊會計師的指示提出來的。這是千秋萬代的事業(yè)，是為社會主義市場經濟奠基的一件極為重要的事情?！?000年9月，在朱總理的親自關懷和指導下，上海國家會計學院正式組建，成為全國性的企業(yè)高管、經濟管理干部、注冊會計師、總會計師（財務總監(jiān)）的職業(yè)后續(xù)教育基地。2001年4月16日，一向惜墨如金的朱镕基總理在視察上海國家會計學院時，題寫了著名的“不做假帳”的校訓。建院以來，以財政部為堅強后盾，在各級領導的關懷和指導下，在社會各界的大力支持下，上海國家會計學院歷經艱苦創(chuàng)業(yè)，積極探索高級財金、會計人才的教育規(guī)律，適應經濟社會發(fā)展對高端人才的需求和會計行業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略，面向國家宏觀經濟部門、國有大中型企業(yè)、金融機構和中介機構等開展高層次繼續(xù)教育，形成了清晰的辦學思路、辦學模式以及短期培訓、學位教育、遠程教育“三足鼎立”的事業(yè)格局，在教育界形成了相當的影響力和知名度，被譽為會計人員的“精神家園”。截至目前，學院已累計舉辦短期培訓、學位教育、遠程教育、國際培訓等各類項目5100多班次，培訓學員近40萬多人次，這樣的培訓規(guī)模在全國的教育機構中是不多見的。

　　作為國家級的人才培訓基地，學院主要從事針對企業(yè)高管、總會計師、財務總監(jiān)以及注冊會計師等的高級經濟管理人才的繼續(xù)教育。建院以來，學院承擔了全國會計領軍人才培訓項目、國有企業(yè)總會計師培訓、獨立董事培訓等一系列國家級、全國性人才培養(yǎng)工程。2005年財政部推出的全國會計領軍人才培訓項目，是我國針對財務會計人員推出的層次最高、培訓時間最長、要求最為嚴格的人才培養(yǎng)項目，項目的推出受到了社會各界的廣泛關注。根據財政部最新推出的《會計行業(yè)中長期人才發(fā)展規(guī)劃（2010-2020）》，到2020年，要培養(yǎng)2000名左右的全國會計領軍人才，擔當會計行業(yè)領軍重任，其中包括900名企業(yè)類會計領軍人才、200名行政事業(yè)類會計領軍人才、700名注冊會計師類會計領軍人才以及200名學術類會計領軍人才，我院主要負責企業(yè)類會計領軍人才的培養(yǎng)工作。除承擔國家級人才培養(yǎng)工程外，學院還接受企業(yè)集團、金融機構等的委托舉辦各類量身定制的培訓課程，與這些機構開展了良好的培訓合作。隨著全國會計領軍人才培養(yǎng)工程等國家級人才培養(yǎng)工程的深入開展，學院服務國家人才戰(zhàn)略的能力、與大企業(yè)集團、金融機構等大客戶的合作能力以及高層項目的設計能力都有了大幅提升，近年來，短期培訓不斷向長期化、系統化方向發(fā)展。根據財政部“服務財政中心工作”的要求，學院高度重視財稅系統的培訓工作，截至目前，學院已與全國所有省、市、自治區(qū)的財稅系統合作，舉辦了針對財政與稅務系統公務員、各地高級會計師等的培訓。此外，開展注冊會計師繼續(xù)教育、為中國培養(yǎng)更多高素質的“經濟警察”也是國家會計學院的一項重要任務，學院每年都與中國注冊會計師協會以及上海注冊會計師協會等地方協會合作開展注冊會計師的繼續(xù)教育培訓。

　　2002年，學院與香港中文大學合作，推出了中國內地最早的會計碩士專業(yè)學位項目，在全國引起了極大反響。正是在這一項目的推動下，2005年，教育部在全國推出了會計碩士專業(yè)學位項目。隨著辦學的深入，學院認為要真正發(fā)揮財務、會計在企業(yè)管理中的作用，僅提升財務、會計專業(yè)人員的專業(yè)知識和綜合能力是不夠的，還必須提高企業(yè)高管層對財務、會計在企業(yè)管理中的作用的認識。為此，2003年，學院與美國亞利桑那州立大學合作推出了金融與財務方向的EMBA項目，項目依靠專業(yè)化的定位、國際前沿的課程內容、人性化的教學服務和“鉆石級”的豪華師資陣容，吸引了八方精英紛至沓來，參加學習的學員中董事長/總裁/行長級的學員占到60%，一批政府機關的省級、廳局級高級官員參加了項目的學習。該項目師資力量之強大、學員層次之高，在國內屈指可數，深受工商業(yè)界精英的歡迎，該項目的成功也標志著學院在探索高級經濟管理人才培養(yǎng)模式方面取得了明顯的成效。2008、2009年、2010年、2011年該EMBA項目被英國《金融時報》分別評為全球42名、41名、28名以及20名。2016年位列30強，這也是唯一連續(xù)七年進入全球EMBA百強榜的金融財務方向EMBA。2010年，學院還開設了針對學位項目校友的、以國學課程為主要內容的后EMBA項目。除此以外，學院還在2005年與上海財經大學合作推出了會計碩士專業(yè)學位項目（MPAcc）。經過十年的努力，學院的學位項目逐步發(fā)展到從有到強、樹立品牌的階段，形成了“EMBA項目培養(yǎng)精通金融與財務的CEO”—“EMPAcc項目培養(yǎng)CFO”—“MPAcc項目培養(yǎng)未來的CFO”的高級財金專業(yè)人才梯隊培養(yǎng)模式。

　　舉辦高層次的經濟管理人才培訓特別是高級會計、財務、金融人才培訓是國家會計學院的主要任務和長期目標。但作為由中國政府設立的繼續(xù)教育基地，國家會計學院顯然也肩負著提高會計人員整體的從業(yè)素質和為國家的經濟發(fā)展戰(zhàn)略如西部大開發(fā)戰(zhàn)略培養(yǎng)人才的重要使命，這也是國家會計學院必須積極承擔的社會責任。為此，建院以來，學院便積極籌辦遠程教育，利用網絡低成本、不受地域限制的優(yōu)勢為廣大的基層會計人員以及西部地區(qū)的經濟管理人才提供優(yōu)質的培訓課程。學院目前開設的遠程教育項目主要有與各省財政系統、注冊會計師系統、企業(yè)集團合作的會計從業(yè)人員遠程后續(xù)教育項目，以及高級會計師的考前輔導項目。2010年，學院與中華會計函校合作，推出了針對農村基層財政干部的遠程后續(xù)教育課程，為我國的新農村建設提供智力支持。學院還是世界銀行全球發(fā)展學習網絡—上海遠程學習中心（簡稱GDLN—Shanghai DLC）所在地。2003年6月啟動以來，該中心與中國西部開發(fā)遠程學習網（CDDLN）等廣泛合作，舉辦了幾十期遠程培訓、研討、考察交流與對話活動,中心在世界范圍內整合優(yōu)質資源所開展的這些低成本、高效率、大規(guī)模的遠程教育活動對于促進西部地區(qū)的經濟管理理念與思維創(chuàng)新發(fā)揮了積極作用。

　　學院還是中國政府倡導成立的亞太財經與發(fā)展學院（AFDI）所在地，該學院是中國政府在亞太經濟合作組織（APEC）框架下倡導建立的第一個旨在促進區(qū)域能力建設的機構。AFDI前身為APEC財長會機制下發(fā)起設立的APEC金融與發(fā)展項目，2001年，江澤民主席親自為該項目揭牌。2004年11月，在智利首都圣地亞哥召開的APEC第12次領導人非正式會議上，胡錦濤主席鄭重宣布中國將把APEC金融與發(fā)展項目提升為亞太財經與發(fā)展中心，為亞太大家庭各成員加強在財經與發(fā)展領域的交流合作和能力建設提供一個更有力的平臺。2008年11月22日至23日，在秘魯利馬舉行的APEC第十六次領導人非正式會議上，胡錦濤主席強調：“我們支持設在上海的亞太財經與發(fā)展中心繼續(xù)發(fā)揮能力建設平臺作用，為各成員開展更多培訓和能力建設活動?！?通過不斷努力，成立以來，AFDI面向亞太地區(qū)積極組織財經與發(fā)展領域的人員培訓、高層論壇和資助課題研究等活動，促進了亞太地區(qū)各經濟體之間、官學商之間圍繞重大財經問題的交流，發(fā)揮了“財經外交”輔助平臺的作用。

　　放眼未來，學院第四次董事會確立的學院發(fā)展目標是：

　　堅持“國際知名會計學院”的辦學目標，進一步探索完善符合三所學院各自實際的特色發(fā)展模式，以培養(yǎng)高層次、應用型、國際化的會計和經濟管理人才為目標，創(chuàng)新辦學方式，突出教學科研，加強師資隊伍和管理團隊建設，不斷提升學院競爭力和影響力，更好地為實現會計強國目標服務，為財政中心工作服務，為經濟社會發(fā)展服務。